水分子の分子軌道計算

◎折れ線AB2型分子の分子軌道計算

プログラム名: c2v12

マニュアル(ステップバイステップ)バージョン

f01作成(f25準備) ⇒ makef05 ⇒ scat計算 ⇒ 周辺プログラム を
一つ一つ手動で実行していきます


c2v12makef05scatの具体的な使い方

水分子H2Oの場合


1.DV-Xα計算環境(コマンドプロンプト画面)で、
  これから計算で用いる適当な空ディレクトリを準備します。

 cd calc [Enter] ・・・c:\dvxaからc:\dvxa\calcに移動します
 md h2o [Enter] ・・・c:\dvxa\calcの中に、h2oディレクトリを作成します
 cd h2o [Enter] ・・・c:\dvxa\calcからc:\dvxa\calc\h2oに移動します


2.プログラムc2v12を起動してH2O分子のDV-Xα計算に必要なF01とF25を準備します。

 c2v12 [Enter] ・・・プログラムc2v12を起動します
 8 [Enter] ・・・酸素の原子番号
 1 [Enter] ・・・水素の原子番号
 0.9579 [Enter] ・・・O-Hの結合距離
 104.50 [Enter] ・・・H-O-Hの角度


3.プログラムmakef05を起動してH2O分子のDV-Xα計算に必要なF05を作成します。

 makef05 [Enter] ・・・プログラムmakef05を起動します


4.ノンスピン版のscatを起動してH2OのDV-Xα分子軌道計算を行います。

 dvscat n [Enter] ・・・scat計算を10サイクル回します
 dvscat n [Enter] ・・・scat計算をさらに10サイクル回します
 dvscat n [Enter] ・・・scat計算をさらに10サイクル回します
 type f06z | more [Enter] ・・・先頭に“Converged”とあればscat計算は収束しています


5.周辺プログラムを駆使してH2OのDV-Xα分子軌道計算結果(数値デ−タ)を見ていきます。

 type f08e [Enter] ・・・H2Oの分子軌道(計算結果)を見ます
 hlgaps [Enter] ・・・HOMO, HOMO-1, HOMO-2と、LUMO, LUMO+1との間隔を計算します
 netc n [Enter] ・・・H2Oのネットチャージを計算します
 type i08 [Enter] ・・・H2Oのネットチャージを見ます
 bndodr n [Enter] ・・・H2Oのボンドオーバラップポピュレーションを計算します
 type bn8 [Enter] ・・・H2Oのボンドオーバラップポピュレーションを見ます
 popanl n [Enter] ・・・H2Oの分子軌道の成分原子軌道の割合を計算します
 type f08p | more [Enter] ・・・H2Oの分子軌道の成分原子軌道の割合を見ます


6.周辺プログラムを駆使してH2OのDV-Xα分子軌道計算結果をグラフィカルに可視化していきます。



1.〜4.の操作画面を以下に掲載します。

c2v12_1
c2v12_2


c2v12makef05scat で簡単に電子状態計算できる分子の例
(一般的な、折れ線 AB2型分子の例)
No. 化学式 原子番号 結合距離(Å) 角度(°) 備考
AB2 A B A-B B-A-B
1 H2O 8 1 0.9579 104.50 水(water), 量子材料化学入門 p. 70〜75
2 H2S 16 1 1.3366 87.77 硫化水素(hydrogen sulfide)
3 O3 8 8 1.2716 117.79 オゾン(ozone)
4 SO2 16 8 1.4308 119.33 二酸化硫黄(sulfur dioxide)
5 NO2 7 8 1.1946 133.85 二酸化窒素(nitrogen dioxide)
6 SF2 16 9 1.5875 98.05 二フッ化硫黄(sulfur difluoride)
7 SCl2 16 17 2.015 102.7 二塩化硫黄(sulfur dichloride)
8 ClO2 17 8 1.4698 117.40 二酸化塩素(chlorine dioxide)
9 Cl2O 8 17 1.6959 110.89 一酸化二塩素(dichlorine oxide)
10 GeCl2 32 17 2.183 100.3 塩化ゲルマニウム(II) (germanium(II) chloride)
11 GeF2 32 9 1.7321 97.15 フッ化ゲルマニウム(II) (germanium(II) fluoride)
12 OF2 8 9 1.4052 103.07 二フッ化酸素(dioxygen fluoride)
13 SeO2 34 9 1.6076 113.83 二酸化セレン(selenium dioxide)
14 SiF2 14 9 1.590 100.8 二フッ化ケイ素(silicon difluoride)
・表中の原子間距離・角度は、(社)日本化学会編 化学便覧 基礎編 改訂5版 丸善 2004年 に掲載されている数値です。
・表中の備考欄は、化学大辞典理化学辞典無機化合物・錯体辞典有機化合物辞典より一部抜粋しております。


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