テトラクロロ白金(II)酸の分子軌道計算

◎平面四配位AB4型錯体(錯イオン)の分子軌道計算

プログラム名: d4h14

マニュアル(ステップバイステップ)バージョン

f01作成(f25準備) ⇒ makef05 ⇒ scat計算 ⇒ 周辺プログラム を
一つ一つ手動で実行していきます


d4h14makef05scatの具体的な使い方

テトラクロロ白金(II)酸[PtCl4]2-の場合


1.DV-Xα計算環境(コマンドプロンプト画面)で、
  これから計算で用いる適当な空ディレクトリを準備します。

 cd calc [Enter] ・・・c:\dvxaからc:\dvxa\calcに移動します
 md ptcl4 [Enter] ・・・c:\dvxa\calcの中に、ptcl4ディレクトリを作成します
 cd ptcl4 [Enter] ・・・c:\dvxa\calcからc:\dvxa\calc\ptcl4に移動します


2.プログラムd4h14を起動して[PtCl4]2-のDV-Xα計算に必要なF01とF25を準備します。

 d4h14 [Enter] ・・・プログラムd4h14を起動します
 78 [Enter] ・・・白金の原子番号
 2 [Enter] ・・・白金の酸化数
 17 [Enter] ・・・塩素の原子番号
 -1 [Enter] ・・・塩素の酸化数
 2.308 [Enter] ・・・Pt-Clの結合距離(Å)


3.エディタ(メモ帳など)でF01を編集(確認)します。

以下、メモ帳での作業例を紹介いたします。


スタートすべてのプログラム(P)アクセサリメモ帳 を起動します。

DV-Xα メモ帳

ファイル(F)開く(O)で、c:\dvxa\calc\ptcl4\f01 を開きます。

DV-Xα メモ帳

開くときは、ファイルの種類(T):テキスト文書(*.txt)からすべてのファイルに変更します。

DV-Xα メモ帳

これを必要があれば編集して(書き加えて)保存、メモ帳を終了します。
すでに、NEQ = 1(白金) の CHG(電荷)は 2.0に、
NEQ = 2(塩素) の CHG(電荷)は -1.0になっているはずです(通常は編集不要)。

DV-Xα メモ帳



4.プログラムmakef05を起動して[PtCl4]2-のDV-Xα計算に必要なF05を作成します。

 makef05 [Enter] ・・・プログラムmakef05を起動します


5.ノンスピン版のscatを起動して[PtCl4]2-のDV-Xα分子軌道計算を行います。

 dvscat n [Enter] ・・・scat計算を10サイクル回します
 dvscat n [Enter] ・・・scat計算をさらに10サイクル回します
 dvscat n [Enter] ・・・scat計算をさらに回します
 type f06z | more [Enter] ・・・先頭に“Converged”とあればscat計算は収束しています


6.周辺プログラムを駆使して[PtCl4]2-のDV-Xα分子軌道計算結果(数値デ−タ)を見ていきます。

 type f08e [Enter] ・・・[PtCl4]2-の分子軌道(計算結果)を見ます
 hlgap [Enter] ・・・HOMOとLUMOの間隔を計算します
 hlgaps [Enter] ・・・HOMO, HOMO-1, HOMO-2と、LUMO, LUMO+1との間隔を計算します
 netc n [Enter] ・・・[PtCl4]2-のネットチャージを計算します
 type i08 [Enter] ・・・[PtCl4]2-のネットチャージを見ます
 bndodr n [Enter] ・・・[PtCl4]2-のボンドオーバラップポピュレーションを計算します
 type bn8 [Enter] ・・・[PtCl4]2-のボンドオーバラップポピュレーションを見ます
 popanl n [Enter] ・・・[PtCl4]2-の分子軌道の成分原子軌道の割合を計算します
 type f08p | more [Enter] ・・・[PtCl4]2-の分子軌道の成分原子軌道の割合を見ます


7.周辺プログラムを駆使して[PtCl4]2-のDV-Xα分子軌道計算結果をグラフィカルに可視化していきます。



d4h14makef05scat で簡単に電子状態計算できる分子の例
(一般的な、平面四配位 AB4型錯体(錯イオン)の例)
No. 化学式 A B 結合距離(Å) 備考
AB4 原子番号 酸化数 原子番号 酸化数 A-B
1 [PtCl4]2- 78 2 17 -1 2.308
(K塩)
テトラクロロ白金(II)酸イオン
tetrachloroplatinate(II)

イオンは赤色, K2[PtCl4]は赤褐色の
正方晶系結晶, 密度は3.38 g/cm3, 反磁性.
2 [PdCl4]2- 46 2 17 -1 2.318
(K塩)
テトラクロロパラジウム(II)酸イオン
3 [AuCl4]- 79 3 17 -1 2.282 テトラクロロ金(III)酸イオン
構造データ:文献1
・表中の原子間距離は、(社)日本化学会編 化学便覧 基礎編 改訂5版 丸善 2004年 に掲載されている数値です。
・表中の備考欄は、化学大辞典理化学辞典無機化合物・錯体辞典有機化合物辞典より一部抜粋しております。
文献1) A.V.Polishchuk, E.T.Karaseva, M.A.Pushilin (2009) Acta Crystallogr., Sect. E: Struct.Rep.Online, 65, m1377.


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