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水分子(H2O)を配位子とする
酸素架橋不完全キュバン型モリブデン三核アクア錯体
(錯陽イオン)

[Mo3O4(H2O)9]4+

Oxygen-Bridged Incomplete Cubane-Type
Molybdenum Aqua Cluster Complex

Nonspin, C3v


化学式:[Mo3O4(H2O)9]4+[Animated GIF, 269 KB]
原子数:34
原子種数:9
軌道数:27
総電子数:244
スピン分極:考慮に入れない計算(ノンスピン版SCAT)
MSCF:SCFS
サンプル点数:400000
F15ファイルサイズ:668 MB
10サイクルの計算時間:57 分 9 秒(Watcom Fortran 77 Version 11.0c)
対称軌道:C3v34

文献:

((1))Genta Sakane, Takashi Shibahara, and Hirohiko Adachi; "Discrete Variational (DV)-Xα Calculations of Incomplete Cubane-Type Molybdenum Clusters [Mo3X4(H2O)9]4+ (X = O, S)", Journal of Cluster Science, 6(4), 503-521 (1995).

((2))○坂根弦太, 柴原隆志, 足立裕彦; "不完全キュバン型モリブデンアクア錯体[Mo3X4(H2O)9]4+(X = O, S)の電子状態", 第5回DV-Xα研究会(東京都・早稲田大学国際会議場・井深大記念ホール(発表会場)・3階第1会議室(ポスター会場)), 平成4(1992)年8月4日(火)〜6日(木), DV-Xα研究協会会報(Bulletin of the Society for Discrete Variational Xα), 5, 22, pp. 22-1〜22-16 (1992).

((3))柴原隆志, ○坂根弦太, 山崎幹緒, 足立裕彦; "モリブデン硫黄クラスタ−錯体の電子状態",第3回DV-Xα研究会(兵庫県神戸市・舞子ビラ), 平成2(1990)年8月8日(水)〜9日(木), DV-Xα研究協会会報(Bulletin of the Society for Discrete Variational Xα), 3, 17, pp. 17-1〜17-10 (1990).


contrd + VENUS で作画するのに必要なファイルは、まとめてこちらからダウンロードできます(zipで圧縮してあります)。
  → complex08.zip(f01,f09,f39,c04d,complex08.vcs) [download] 193 KB 2005.01.23

  ・contrd入力ファイル:c04d (ascii, 1 KB), f09 (binary, 38 KB), f39 (binary, 199 KB)

  ・VICS入力ファイル:f01 (ascii, 2 KB), c04d (ascii, 1 KB)

  ・VICS出力ファイル:complex01.vcs (ascii, 7 KB)

  ・VEND入力ファイル:contrd g [Enter]を実行することにより生成されます。



【F01】 ←クリックするとご覧いただけます【2 KB】
     ※dv2f01でF05より作成したF01です。

【F05】 ←クリックするとご覧いただけます【10 KB】
     ※単結晶X線構造解析で求めた原子間距離・角度より、錯陰イオン部分にC3v対称があるものと仮定して、Z-Matrixを組んで求めた座標を用い、手作りで作成したF05(SCAT計算が収束した後のF05)です。座標は最終的に、プログラムc3v1, c3v3, c3v6を使って完全にC3v対称となるように求めました。

【F25】 ←クリックするとご覧いただけます【33 KB】
     ※対称軌道作成プログラム“SymWave”で作成したF25(C3v対称、34原子9原子種用)です。
     ※SymWave: 井本英夫, DV-Xα研究協会会報(Bulletin of the Society for Discrete Variational Xα), 3, 21-1〜21-6 (1990).

【WAVNUM】 ←クリックするとご覧いただけます【5 KB】
     ※wavnumの出力結果です。分子軌道の番号の一覧です。

【c04d】 ←クリックするとご覧いただけます【1 KB】
     ※contrdの一般入力ファイルです。

【F08E】 ←クリックするとご覧いただけます【8 KB】
     ※計算結果(分子軌道のエネルギー準位一覧)です。

【F08E.prests】 ←クリックするとご覧いただけます【3 KB】
     ※prestsでF08Eより作成したF08E.prestsです。占有軌道と空軌道のエネルギー間隔の一覧です。

【F08P】 ←クリックするとご覧いただけます【52 KB】
     ※計算結果(各分子軌道を構成する原子軌道の割合一覧)です。

【F05MOLDA.XYZ】 ←クリックするとご覧いただけます【2 KB】
     ※dv2moldaでF05より作成したF05MOLDA.XYZです。Molda for Windowsで読み込むことができる座標ファイルです。

【F05C3D.INP】 ←クリックするとご覧いただけます【2 KB】
     ※dv2chem3dでF05より作成したF05C3D.INPです。Chem3Dで読み込むことができる座標ファイルです。

【F05.daph】 ←クリックするとご覧いただけます【3 KB】
     ※dv2daphでF05より作成したF05.daphです。結晶解析ユニバーサルプログラムシステム UNICS の DAPH で読み込むことができる座標ファイルです。
     ※UNICS: 桜井敏雄編, 日本結晶学会, (1967).
     ※DAPH: 芦田玉一編, 大阪大学大型計算機センター, (1973).

【F05.daph.out】 ←クリックするとご覧いただけます【44 KB】
     ※daphを起動し、F05.daphを読み込んで、原子間距離・角度を計算した結果出力ファイルです。
     ※DAPH: 芦田玉一, HITAC 5020E version, (1966).

【I08】 ←クリックするとご覧いただけます【2 KB】
     ※NETCの出力です。各原子軌道の電子数と有効電荷です。






【計算した錯体(錯陽イオン部分)の全景(棒球模型)】
※図をクリックすると大きな画像をご覧いただけます
【左上図:82 KB,中上図:55 KB,右上図:74 KB】
【左下図:79 KB,中下図:78 KB,右下図:82 KB】







【電子密度の図】(Isosurface level: 0.02a0-3)
◎contrdでのメッシュ数(c04dの1行目): 51 x 51 x 51
◎VENDでのSmoothing: apply
※図をクリックすると大きな画像をご覧いただけます
【左上図:131 KB,中上図:86 KB,右上図:138 KB】
【左下図:132 KB,中下図:108 KB,右下図:119 KB】







【静電ポテンシャルの図】(Isosurface level: -4.0 Ry)
◎contrdでのメッシュ数(c04dの1行目): 51 x 51 x 51
◎VENDでのSmoothing: apply
※図をクリックすると大きな画像をご覧いただけます
【左上図:121 KB,中上図:82 KB,右上図:106 KB】
【左下図:109 KB,中下図:104 KB,右下図:115 KB】







【等電子密度表面における静電ポテンシャルの図】
【The electrostatic potential painted charge density surface for [Mo3O4(H2O)9]4+
(電子密度のIsosurface level: 0.0512a0-3, 静電ポテンシャルのSurface Colorization Scale: 1.06)
◎contrdでのメッシュ数(c04dの1行目): 251 x 251 x 251
◎VENDでのSmoothing: does not apply
※図をクリックすると大きな画像をご覧いただけます
【左上図:137 KB,中上図:97 KB,右上図:117 KB】
【左下図:123 KB,中下図:122 KB,右下図:135 KB】







【等電子密度表面における静電ポテンシャルの図(錯陰イオンの棒球表示を加えたもの)】
(電子密度のIsosurface level: 0.0512a0-3, 静電ポテンシャルのSurface Colorization Scale: 1.06)
◎contrdでのメッシュ数(c04dの1行目): 251 x 251 x 251
◎VENDでのSmoothing: does not apply
※図をクリックすると大きな画像をご覧いただけます
【左上図:130 KB,中上図:95 KB,右上図:111 KB】
【左下図:115 KB,中下図:110 KB,右下図:123 KB】







【HOMO 40e の1番目の軌道の図】(Isosurface level: 0.002a0-3/2)
◎contrdでのメッシュ数(c04dの1行目): 51 x 51 x 51
◎VENDでのSmoothing: apply
※図をクリックすると大きな画像をご覧いただけます
【左上図:136 KB,中上図:103 KB,右上図:132 KB】
【左下図:132 KB,中下図:122 KB,右下図:136 KB】







【HOMO 40e の2番目の軌道の図】(Isosurface level: 0.002a0-3/2)
◎contrdでのメッシュ数(c04dの1行目): 51 x 51 x 51
◎VENDでのSmoothing: apply
※図をクリックすると大きな画像をご覧いただけます
【左上図:116 KB,中上図:87 KB,右上図:106 KB】
【左下図:108 KB,中下図:102 KB,右下図:111 KB】







【LUMO 41e の1番目の軌道の図】(Isosurface level: 0.002a0-3/2)
◎contrdでのメッシュ数(c04dの1行目): 51 x 51 x 51
◎VENDでのSmoothing: apply
※図をクリックすると大きな画像をご覧いただけます
【左上図:144 KB,中上図:100 KB,右上図:113 KB】
【左下図:127 KB,中下図:113 KB,右下図:133 KB】







【LUMO 41e の2番目の軌道の図】(Isosurface level: 0.002a0-3/2)
◎contrdでのメッシュ数(c04dの1行目): 51 x 51 x 51
◎VENDでのSmoothing: apply
※図をクリックすると大きな画像をご覧いただけます
【左上図:145 KB,中上図:91 KB,右上図:121 KB】
【左下図:122 KB,中下図:112 KB,右下図:134 KB】



     ※DV-Xα+VENUSをこれから始めたい方は、こちらをご覧ください。

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